Parti Kebangsaan Sarawak menyertai semula Barisan Nasional sebagai pengganti Parti Perikatan. Di bawah pakatan baharu, Wong menjadi menteri dalam kabinet negeri Sarawak, memegang beberapa portfolio pada tahun 1980-an, 1990-an dan awal tahun 2000an. Beliau menjadi Menteri Alam Sekitar dan Pelancongan Sarawak dari tahun 1987 hingga 1994. Beliau kemudian menjadi Menteri Alam Sekitar dan Perumahan negeri dari tahun 1995 hingga 1997 dan akhirnya Menteri Alam Sekitar dan Kesihatan Negeri dari tahun 1998 hingga persaraannya Pada tahun 2001.<ref> name=star</> Wong, yang masih berkhidmat sebagai Menteri Alam Sekitar, telah dianugerahkan Anugerah Langkawi untuk bekerja dalam melancarkan penyu laut program pengesanan satelit dan mengetuai projek reefball baru untuk terumbu karang.<ref> name = star </>